Engenharia de dados · Full stack · Geoespacial · Ciência de dados · Botânica
Botânicaem escala desistemas.
Sou Lucas S.B. Jordão, mestre e doutor em Botânica. Passei vinte anos aprendendo como o conhecimento sobre plantas é produzido e seis construindo a infraestrutura que o transforma em decisão — pipelines, aplicações e análise geoespacial para a avaliação do risco de extinção da flora brasileira.
- Situação
- Disponível para novas oportunidades
- Modalidade
- Remoto, híbrido ou Rio de Janeiro
- Disponibilidade
- Início imediato
MIMOSA
DESCRIÇÃO TAXONÔMICA
DESCRIÇÃO TAXONÔMICA
00 / PONTO DE VISTA
A biodiversidade não cabe em uma planilha.
Ela exige sistemas que entendam nomes, lugares, evidências e tempo — e os transformem em decisões que possam ser explicadas.
Minha prática atravessa herbários, código e políticas públicas. Não traduzo ciência para tecnologia: desenho as duas juntas.
01 / CHAVE DE DETERMINAÇÃO
Onde eu entro no seu time
Quatro perfis,
uma pessoa.
Um taxonomista identifica um espécime desconhecido percorrendo uma chave dicotômica: pares de alternativas que estreitam até chegar a um nome. Este perfil é largo de propósito. Percorra a chave para chegar à parte dele que resolve o seu problema.
Comece aqui
O conhecimento de que você precisa…
Determinação
Escolha 1a ou 1b para determinar
PRANCHA MORFOLÓGICA / MIMOSAdiversidade de formas e termos
PUBLICAÇÃO EM DESTAQUE / 2020
Taxonomia · Morfologia comparada
Uma linguagem comum
para os tricomas.
Antes de estruturar morfologia como dados, foi preciso organizar a própria linguagem usada para descrever as formas.
No artigo Trichomes in Mimosa, propus com Marli Pires Morim e José Fernando A. Baumgratz uma caracterização dos tricomas do gênero e uma padronização terminológica para tornar seu uso taxonômico mais consistente e comparável.
FLORA · VOLUME 272ARTICLE 151702
Ler o artigo 02 / ESTUDO DE CASO
CNCFlora · 2020—2026
Uma infraestrutura
para avaliar a flora.
Avaliar o risco de extinção é coordenar evidências fragmentadas, análises espaciais e muitas pessoas. No CNCFlora/JBRJ, converti esse processo em uma arquitetura de dados, filas e interfaces. Levantei e documentei os requisitos com Sphinx-Needs, mantendo rastreabilidade entre necessidade e implementação, e criei o catálogo de serviços da equipe em Backstage.
Meu escopo
Arquitetura · engenharia de requisitos · desenvolvimento full stack · ETL · automação · geoprocessamento · CI/CD · catálogo de serviços · observabilidade
Arquitetura do trabalhodo dado bruto à decisão
COORDENARFluxo de trabalhoetapas · papéis · auditoria
PROCESSARBull–ProFloraETL · filas · logs
INTERPRETARAvalia–CNCFloramapas · métricas · texto
PUBLICARDados abertos e métodos inovadorespáginas web · aplicabilidade · artigos científicos
Protótipo não adotadoCoordenar
Painel de Acompanhamento
Concebi e construí uma aplicação para tornar visíveis etapas, responsáveis, pendências e progresso de centenas de avaliações em tempo real.
Minha contribuição
A aplicação não foi implantada institucionalmente. O fluxo efetivamente usado permaneceu em uma planilha que configurei com Apps Script, APIs, mensageria e registros operacionais — e que sustentou a operação até o fim do período.
ETL em operação01 / 02
Orquestrar
Bull–ProFlora
Projetei e implementei o ETL que conectou o ProFlora a filas assíncronas, tornando processamentos pesados controláveis, repetíveis e auditáveis.
Minha contribuição
A camada de processamento e suas integrações foram minha entrega. A interface administrativa mostrada é o Bull Board, painel público e genérico do ecossistema Bull.
Aplicação interna01 / 05
Analisar
Avalia–CNCFlora
Desenvolvi um ambiente para reunir dados taxonômicos, análises geoespaciais, gráficos e textos de apoio à avaliação segundo os critérios da IUCN.
Minha contribuição
Atuei da arquitetura à interface: modelei os dados em PostgreSQL/PostGIS, construí back-end em NestJS expondo APIs REST e GraphQL, desenvolvi o front-end em Next.js, implementei os pipelines de CI/CD em GitLab e integrei MapBiomas, métricas de AOO e EOO, tendências de uso do solo e a redação estruturada das justificativas.
SISTEMA LEGADOAcervo histórico
→
ORQUESTRAÇÃOAirflow
TRANSFORMAÇÃOdbtProFloradados recuperados
Resgatar
Resgate de dados legados
Planejei e executei o resgate dos dados do sistema legado, migrando o acervo histórico para a arquitetura do ProFlora.
Minha contribuição
Explorar dados públicos Conduzi todas as etapas da migração: orquestrei extração e carga com Apache Airflow, modelei e validei as transformações com dbt e disponibilizei o legado recuperado na nova base. Esses dados hoje alimentam o portal público do CNCFlora.
03 / TRABALHO SELECIONADO
Projetos que fazem
o conhecimento circular.
Software, dados e publicações concebidos para que conhecimento científico possa ser consultado, testado e reutilizado. Tudo abaixo é público e verificável.
10 projetos em Todos
01Abrir projeto Taxonomia como código Taxonomia
TypeTaxonScript
Framework publicado para transformar descrições biológicas em dados tipados, validáveis, versionáveis e colaborativos — com registro acadêmico no Google Patents.
02Abrir projeto Conhecimento explorável Software
TTS–Mimosa
Uma prova de conceito que conecta caracteres morfológicos, imagens e fontes em uma interface taxonômica navegável.
03Abrir projeto Caracteres taxonômicos como software Taxonomia
TTS–Mimosa Docs
Documentação tipada dos caracteres de Mimosa, organizada em módulos navegáveis e mantida com tecnologias de engenharia de software.
04Abrir projeto Conservação orientada por dados Conservação
LULC × Leguminosae
Séries históricas de cobertura e uso do solo convertidas em evidências quantitativas para avaliações do risco de extinção.
05Abrir projeto Histórico, ranking e nomes aceitos Software
FFB Cronologia
Aplicação de utilidade geral que compara 394 versões da Flora e Funga do Brasil, revela mudanças taxonômicas, cria rankings filtráveis e localiza nomes aceitos em lote com busca flexível.
06Abrir projeto Matemática no navegador Software
Curva
Calculadora gráfica escrita do zero, sem nenhuma biblioteca de matemática: parser de expressões próprio, derivada simbólica passo a passo, integração e limites numéricos, ajuste de curvas com resíduos e SSE, estatística e geometria analítica. Nasceu da graduação em Ciência de Dados.
07Abrir projeto Escrita científica assistida Ciência aberta
Quarto Scientific Writing
Extensão com diagnósticos em tempo real de estilo, estrutura, legibilidade e consistência para manuscritos científicos.
08Abrir projeto Leitura sem ruído Ciência aberta
Quarto Focus Mode
Modo de foco, apresentação por seções, navegação por teclado e progresso inteligente para sites e livros Quarto.
09Abrir projeto Um documento, múltiplas versões Ciência aberta
Quarto Conditional Vars
Extensão que renderiza conteúdo condicional a partir de variáveis do projeto, com regras combináveis e compatibilidade entre engines Quarto.
10Abrir projeto Como citar, em um clique Ciência aberta
Quarto cite-this
Extensão que adiciona um controle acessível de "como citar" a livros e sites Quarto, com cópia em texto por estilo CSL ou em BibTeX. As citações são montadas na renderização, sem biblioteca no navegador, e funcionam com recursos embutidos ou sem JavaScript.
04 / MATERIAL DIDÁTICO
Cursos e apostilas de acesso aberto
Uma estante para
ensinar em público.
Livros de curso escritos em Quarto e publicados abertos: legislação ambiental, avaliação de risco de extinção, política pública e filoinformática. A espessura de cada lombada acompanha o número de capítulos.
AULA 01 · 23 capítulosLegislação aplicada à proteção da flora e vegetações brasileiras
- Lei do Bioma Mata Atlântica
- Lei Florestal e gestão de florestas públicas
- Crimes e infrações contra a flora
- Montagem e alinhamento de sequências
- Modelos de evolução e análise filogenética
- Filogenia no R
- PRONABIO, CONABIO e Pró-Espécies
- Listas nacionais oficiais de espécies ameaçadas
- CNCFlora/JBRJ e CITES
- Dos princípios fundamentais
- Da organização do Estado e dos Poderes
- Da ordem econômica e da ordem social
- Conhecimento e conservação da biodiversidade
- Utilização sustentável e repartição de benefícios
- Fortalecimento jurídico e institucional
- Lista Vermelha da IUCN
- Qualidade dos dados
- Categorias e critérios
- Ordenamento jurídico brasileiro
- Direito ambiental constitucional
- Política Nacional do Meio Ambiente
- Visualizador de chaves dicotômicas
- Modo de identificação passo a passo
- Editor JSON da estrutura
08 volumes · 74 capítulos · acesso aberto
05 / TECNOLOGIAS
Da escrita científica à infraestrutura
Tecnologias que atravessam
o trabalho.
44tecnologias & métodos
Um repertório construído em problemas reais: aplicações científicas, engenharia de dados, publicação reprodutível e infraestrutura.
01Linguagens & interfaces10 itens
02Dados & pipelines15 itens
03Infraestrutura & cloud9 itens
04Publicação & métodos10 itens
JavaScriptLinguagens & interfaces
TypeScriptLinguagens & interfaces
PythonLinguagens & interfaces
RLinguagens & interfaces
Node.jsLinguagens & interfaces
ReactLinguagens & interfaces
Next.jsLinguagens & interfaces
NextraLinguagens & interfaces
GraphQLLinguagens & interfaces.*RegExLinguagens & interfaces
dbtDados & pipelines
MongoDBDados & pipelines
PostgreSQLDados & pipelines
Apache ParquetDados & pipelines
DuckDBDados & pipelines
TrinoDados & pipelines
RedisDados & pipelines
ClickHouseDados & pipelines
Apache AirflowDados & pipelines
Apache KafkaDados & pipelines
RabbitMQDados & pipelines
NumPyDados & pipelines
PandasDados & pipelines
JupyterDados & pipelines
Google Earth EngineDados & pipelines
LinuxInfraestrutura & cloud
DebianInfraestrutura & cloud
FedoraInfraestrutura & cloud
DockerInfraestrutura & cloud
GitInfraestrutura & cloud
BackstageInfraestrutura & cloud
Google CloudInfraestrutura & cloud
AWSInfraestrutura & cloud
AzureInfraestrutura & cloud
LaTeXPublicação & métodos
QuartoPublicação & métodos
SphinxPublicação & métodosSphinx-NeedsPublicação & métodos
Reveal.jsPublicação & métodos◇CRISP-DMPublicação & métodos
KKDDPublicação & métodos
ScrumPublicação & métodos↗AgilePublicação & métodos
GIMPPublicação & métodos06 / FENOLOGIA
Ritmo de trabalho, 2023—2026
Fenologia de um
repositório vivo.
Fenologia é o estudo dos ciclos de atividade de uma planta ao longo do ano: quando brota, quando floresce, quando descansa. O mesmo instrumento serve para ler quatro anos de commits.
A escala é comum aos quatro anos — o GitHub normaliza cada ano em separado, o que faria um ano fraco parecer tão intenso quanto um ano forte.
- Contribuições no período
- 4.654
- Dias em atividade
- 776
- Pico em um único dia
- 96
- Período observado
- 2023—26
Fonte: API de contribuições do GitHub · lsbjordao · inclui repositórios privados · capturado em 30 DE JUL. DE 2026
| Ano | JAN | FEV | MAR | ABR | MAI | JUN | JUL | AGO | SET | OUT | NOV | DEZ |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2023 | 21 | 62 | 58 | 62 | 99 | 61 | 162 | 213 | 148 | 29 | 80 | 135 |
| 2024 | 88 | 103 | 110 | 171 | 86 | 43 | 38 | 72 | 109 | 104 | 65 | 22 |
| 2025 | 17 | 87 | 122 | 187 | 64 | 26 | 17 | 17 | 10 | 153 | 256 | 36 |
| 2026 | 38 | 128 | 109 | 208 | 466 | 271 | 301 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
Arquivo de trajetória · Botânica01 / 19
Aprendi no campo.
Campo · prática botânicaLer a planta antes de registrar o dadoExpedições botânicas · Brasil
07 / TRAJETÓRIA
Do espécime
à infraestrutura.
Antes dos pipelines, vieram as trilhas, as bancadas e as coleções. Foi ali que aprendi a observar com rigor, registrar contexto e transformar evidência dispersa em conhecimento que outras pessoas conseguem usar.
Campo · prática botânica
Conhecimento com os pés no chão
Expedições botânicas · BrasilColetar é decidir em condições reais: observar, documentar, preservar contexto e voltar com evidência confiável. Essa disciplina de campo continua orientando a forma como projeto dados e sistemas.
Laboratório · biologia molecular
Da morfologia ao DNA
Cenargen / EMBRAPA · Brasília, DFDurante o doutorado, trabalhei no laboratório do Cenargen/EMBRAPA, aproximando dados moleculares, filogenia, biogeografia e a história evolutiva das plantas que eu conhecia no campo.
Herbários · coleções científicas
Acervos físicos, conhecimento acessível
Museu Nacional / UFRJ · NYBGTrabalhei com coleções botânicas ao longo da formação. Em 2016, passei um ano em intercâmbio no New York Botanical Garden, digitalizando espécimes e ajudando a transformar acervos físicos em dados acessíveis.
Linha do tempo2004 — agora
O primeiro espécime
Começo a estudar Mimosa na Escola Nacional de Botânica Tropical. O gênero se torna o fio condutor de toda a trajetória.
Taxonomia em profundidade
Mestrado no Museu Nacional/UFRJ: trabalho com coleções em herbários, expedições, descrição morfológica e a primeira espécie nova.
Da morfologia à filogenia
Doutorado no JBRJ. Em 2016, passo um ano no NYBG digitalizando espécimes; no Cenargen/EMBRAPA, trabalho com DNA e filogenia. Biogeografia e seis loci em diálogo — e a primeira programação em R.
Conservação em escala
Analista no Núcleo Lista Vermelha do CNCFlora/JBRJ. Transformo regras, dados e rotinas de avaliação em pipelines, aplicações e fluxos operacionais.
Formalizando a engenharia
Segunda graduação, em Ciência de Dados, para dar nome e método ao que já era prática diária: modelagem, estatística e engenharia de dados.
Procurando o próximo time
Encerro o ciclo no CNCFlora com sistemas em operação, dados legados resgatados e métodos publicados. Procuro uma equipe onde domínio, dados e produto sejam a mesma conversa.
08 / NOTAS & PUBLICAÇÕES
Pensamento em
forma pública.
Visitar o blog 0114 JUL 2026
Flora e Funga do Brasil — Cronologia
Produto digital0215 JUN 2026Improving Scientific Writing in Quarto with Real-Time Feedback
Open source0314 MAR 2024TypeTaxonScript: enhancing data structures in biological systematics
Artigo científico0401 AGO 2022MapBiomas e a avaliação do risco de extinção da flora brasileira
Política pública09 / CONTATO
Próximo capítulo
A ciência e a gestão precisam de
infraestruturas vivas e integradas.
Estou disponível para novas oportunidades e interessado em times onde biodiversidade, dados e produto digital precisam funcionar como uma coisa só. Respondo pelo LinkedIn em até um dia útil.